Das Rektorat ist das Leitungsgremium der Hochschule Bremerhaven. Ihm obliegen alle Angelegenheiten der Hochschule, soweit sie nicht ausdrücklich in andere Zuständigkeit fallen. Dem Rektorat gehören die Rektorin Prof. Dr. Karin Vosseberg, der Konrektor Prof. Dr. Gerhard Feldmeier sowie Dr. Helga Schiwek als Kanzlerin an.